宫崎骏1941年1月5日生于东京都文京区,他在四个兄弟中排名第二。幼年时全家移居到枥木县在宇都宫市和鹿沼市。1947年开始在宇都宫室的一所小学就读,4年级时回到东京,就读于入杉并区大宫小学和永福小学。1953年毕业,进入大宫中学读书,高中进入都立丰多摩高中,开始学习绘画。
1958年因为东映动画《白蛇传》而开始对动画产生兴趣。1959年考入学习院大学政治经济系,主攻“日本产业论”。大学期间热衷于创作漫画,积累了数千张画稿。大学毕业后,宫崎骏于1963年4月进入东映动画公司工作。成为动画师后第一次参与制作的动画是《汪汪忠臣藏》。
1965年10月与同事太田朱美结婚,育有两子。长子宫崎吾朗,1967年1月出生,是吉卜力工作室在2006年7月公映的最新作品《地海传说》的导演;次子宫崎敬介,1969年4月出生,是木版画家。在东映期间参与了《狼少年肯》(东映首部动画连续剧)、《太阳王子》、《长靴里的猫》(制作人矢吹公郎,1969年公映)等动画,担任原画或场面设计。
1971年在完成《阿里巴巴和四十大盗》后离开东映,与高畑勋、小田部羊一共同加入A-Pro工作组,但新企划《皮皮的长袜》最终夭折。准备期间,宫崎骏第一次出国到了瑞典采风。此后一直与高畑勋等人合作企划,完成了《鲁邦三世》、《熊猫家族》、《阿尔卑斯少女》、《三千里寻母记》。
1979年,宫崎骏加入了东京电影新社,继续创作《鲁邦三世》系列。1980年开始为东京电影新社的“电信”公司培训新人。1981年8月《Animage》杂志编辑了宫崎骏特集,宫崎骏也从此开始与德间书店正式合作。1982年2月《Animage》杂志连载《风之谷的娜乌西卡》,同期,他加入《大侦探福尔摩斯》的制片工作。
之后宫崎骏退出东京电影新社。1984年4月,他与妻子创立了个人事务所“二马力”,多年好友兼伙伴的高畑勋也有个人的“畑”事务所;1985年中旬创立吉卜力工作室,拥有独立一组固定的高素质制作团队,制作了大量画功细腻、剧情寓意深远,配上音乐雄壮的作品。他的动画电影多涉及人类与自然,以及反战和飞行的主题。
跟他合作至今的有德间康快(已故)、高畑勋、铃木敏夫、久石让、近藤喜文(殁)、保田道世、贺川爱、高阪希太郎等人。2001年10月1日,代表着他思想艺术的梦想国──三鹰之森吉卜力美术馆正式开幕;2003年4月10日美国《时代》杂志发表“亚洲英雄二十人”,他是其中之一(他是榜上有名的两位日本人其中一人,另一为著名棒球好手松井秀喜);