因为蒋方舟身上体现出来的，正是成年人不再有的率真与直来直去，不太符合人们心目中好孩子的条条框框，所以身边的很多人都排斥她。其实在蒋方舟身上有很多大家争议的地方，当年被清华大学录取的时候就颇受争议，当时一则“清华大学有意降60分调档录取80后少女作家“的新闻在网上引起轩然大波，其实真相并不是大家想象的那样，蒋方舟其实是拿到清华自主招生的降60分优惠，同时也要参加高考，分数达到清华在当地分数线下60分以上的成绩，才会最终被清华录取。
清华大学自主招生降分优惠的流程基本上是校荐、笔试、面试，三关都过了就可以拿到降分优惠了。校荐那一步学校一般是推荐竞赛获奖但是又没有保送上的。蒋方舟是走的自荐，顿时对她有了好感，她走自荐，还可以给其他人省下一个名额。
除了被清华大学破格录取，大学毕业后不久就成为了《新周刊》杂志副主编，这也让很多人吃惊，一个大学刚刚毕业的学生能够一步登天的成为《新周刊》杂志副主编这对于很多人来说是不可思议的，2012年，蒋方舟在微博上祝贺自己从清华大学毕业，2012年7月3日《新周刊》执行总编封新城在微博上给出了确切的答案，蒋方舟将就任《新周刊》杂志副主编。
作家蒋方舟毕业即任副主编引热议，面对外界的争议封新城也做出了回应，认识蒋方舟是从2008年开始，“我当时就发现她比很多同龄人成熟很多。”后来，经过四年的学习，蒋方舟从最开始的特约记者到后来的主笔，是一步步实践、锻炼出来的，“蒋方舟是从主笔的职位提拔到副主编的，这是一个循序渐进的过程，并不是一毕业就当副主编。”
从“美少女作家”到年轻副主编，自称是“命运投机者”的蒋方舟接受中国新闻周刊网采访时面对“副主编”引起的社会关注平静地说：“我觉得这并不是传言的‘空降’，我所有的一切都挺按部就班的。”
2012年方舟子在微博上发表了关于《新周刊》副主编蒋方舟的不少文章是其母亲、作家尚爱兰的代笔引起了不小的争议，当时对于此事有记者通过微博私信向蒋方舟方面求证，当时因为蒋方舟在伦敦看奥运，所以并没有对此事做出任何的回应，她的母亲尚爱兰也没有正面回应，后来此事就不了了之了，虽然不了了之，但是对蒋方舟的名誉产生了负面影响。
蒋方舟一直以来都是一个特立独行，有想法有主见的人，作为同一时期的作家，蒋方舟似乎有点“固守”自己的领域，郭敬明已经拍了两部电影了，韩寒也在做自己的电影。但蒋方舟对自己要不要做这些事情，想得很清楚。
其实蒋方舟少年就成名对于她自己的来说带来荣誉的同时也遭受了不少白眼，进入清华大学学习，蒋方舟也是饱受众人非议，很多人说是清华破格录取，甚至还有人称蒋方舟的高考作文交了白卷。因为很多人不了解这其中的流程，所以都对她有所误解。
